Slovenčina
EnglishPhD. program
Biomedicínske centrum SAV, v. v. i. spolupracuje najmä s fakultami slovenských univerzít v oblasti doktorandského štúdia, pričom je akreditovanou externou vzdelávacou inštitúciou pre nasledujúce študijné programy doktorandského štúdia:
| Lekárska fakulta Univerzity Komenského v Bratislave | normálna a patologická fyziológia |
| onkológia | |
| Prírodovedecká fakulta Univerzity Komenského v Bratislave | molekulárna biológia |
| genetika | |
| mikrobiológia a virológia | |
| fyziológia živočíchov | |
| biochémia | |
| Fakulta telesnej výchovy a športu Univerzity Komenského v Bratislave | vedy o športe |
| Fakulta chemickej a potravinárskej technológie Slovenskej technickej univerzity v Bratislave | biochémia |
| Prírodovedecká fakulta Univerzity Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach | zoológia a fyziológia živočíchov |
| biofyzika |
Témy doktorandského štúdia v BMC SAV, v. v. i. vypísané pre akademický rok 2025/2026
Prírodovedecká fakulta Univerzity Pavla Jozefa Šafárika v Košiciach
Termín na podávanie prihlášok: 31. 5. 2025
Viac informácií o prijímacom konaní na stránke fakulty tu.
| Študijný program: | zoológia a fyziológia živočíchov |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Aktivácia endogénnych mechanizmov vedúcich k neuroprotekcii po cievnej mozgovej príhode |
| Školiteľ: | RNDr. Petra Bonová, PhD. |
| Email: | bonova@saske.sk |
| Kľúčové slová: | Mozgová ischémia, ischemická tolerancia, kondicionovanie |
| Anotácia: | Náhle cievne mozgové príhody predstavujú v súčasnosti vážny sociálno-ekonomický problém s limitovanými možnosťami liečby. Posledné desaťročia sa v experimentálnej praxi stáva atraktívnym riešením prevencie a liečby takýchto stavov fenomén ischemickej tolerancie, teda aktivácia endogénnych mechanizmov vedúcich k protekcii nedokrvených neurónov. Ciele práce: 1. Štúdium mechanizmov ischemickej tolerancie 2. Definovanie úlohy periférnych krvných buniek v navodení ischemickej tolerancie 3. Testovanie spôsobov in vivo a ex vivo kondicionovania 4. Využitie modelov kondicionovania v animálnych modeloch ischemicko-reperfúzneho poškodenia nervového tkaniva |
| Študijný program: | zoológia a fyziológia živočíchov |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Regulácia neurogenézy v mozgu dospelých jedincov |
| Školiteľ: | RNDr. Marcela Martončíková, PhD. |
| Email: | martoncikova@saske.sk |
| Kľúčové slová: | adultná neurogenéza, rostrálna migračná dráha, migrácia neuroblastov |
| Anotácia: | Najväčšou neurogénnou oblasťou v dospelom mozgu je subventrikulárna zóna (SVZ) bočných mozgových komôr. Jej špecifikom je, že bunky vznikajúce v SVZ putujú na dlhé vzdialenosti tzv. rostrálnou migračnou dráhou do bulbus olfactorius, kde sa začleňujú do už existujúcich neurónových okruhov. Poznanie regulačných mechanizmov adultnej neurogenézy je nevyhnutné pre jej prípadné terapeutické využitie. Cieľom dizertačnej práce bude skúmať mechanizmy regulujúce migráciu buniek v rostrálnej migračnej dráhe potkana na základe histologických metód a tiež pomocou in vitro metód. |
| Študijný program: | zoológia a fyziológia živočíchov |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Experimentálne stratégie na liečbu paraplégie spôsobenej úrazom miechy |
| Školiteľ: | MUDr. Karolína Kuchárová, PhD. |
| Email: | kkucharova@saske.sk |
| Kľúčové slová: | Úrazové poranenie miechy, Gliová jazva, Neuroprotekcia, Funkčná regenerácia po SCI |
| Anotácia: | V súčasnosti neexistuje účinná klinická liečba na výraznejšie zlepšenie neurologickej funkcie po úrazovom poškodení miechy (SCI). Navrhovaná dizertačná práca bude využívať rôzne liečebné prístupy, akými sú farmakologické intervencie a rehabilitácia na uľahčenie obnovy funkcií po SCI. Vplyv odlišných liečebných postupov na regeneráciu funkcie bude hodnotený funkčnými, molekulárnymi a morfologickými technikami. Cieľom dizertačnej práce bude skúmanie mechanizmu a vplyvu poúrazovej liečby. Výsledky danej práce môžu v budúcnosti vyústiť do klinickej praxe. |
| Študijný program: | zoológia a fyziológia živočíchov |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Molekulárno-biologická analýza mechanizmu ischemickej tolerancie pri zmierňovaní následkov cievnej mozgovej príhody formou kondicionovania |
| Školiteľ: | RNDr. Rastislav Mucha, PhD. |
| Email: | mucha@saske.sk |
| Kľúčové slová: | Cievna mozgová príhoda, neuroprotektivita, génová expresia, proteínova expresia |
| Anotácia: | Anotácia : Rozpoznanie mechanizmov aktivácie neuroprotektivity po ischemickom poškodení mozgu na molekulovej úrovni je nevyhnutné pre pochopenie tohto procesu. Vieme, že periférna krv veľmi citlivo a špecificky reflektuje zmeny expresie ako génov, tak aj proteínov v mozgu. Ciele: 1) Identifikovať potenciálne markery (génové/proteínové) aktivácie ischemickej tolerancie. 2) Zatriedenie a špecifikácia génov aj proteínov v ich signálnych dráhach s vytvorením reakčnej mapy molekulových kaskád špecifických pre mechanizmus ischemickej tolerancie vo vzorkách krvi človeka a na potkaňom modeli. |
| Študijný program: | biofyzika |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Biologické a väzobné vlastnosti vybraných vírusových a ľudských glykoproteínov a ich klinicky význam pri imunitnej odpovedi |
| Školiteľ: | Mgr. Ivana Nemčovičová, PhD. |
| Email: | ivana.nemcovicova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | vírus, glykoproteín, bunkový receptor, proteínové interakcie, immunomodulácia, rekombinantný expresný systém, genetická manipulácia, kryštalizácia, štruktúrna analýza |
| Anotácia: | Hlavným cieľom práce je podrobne skúmať molekulárne základy imunitného rozpoznávania klinicky významných glykoproteínov kódovaných ľudskými vírusmi. Za týmto účelom plánujeme rekombinantne pripraviť, charakterizovať a stanoviť expresné a purifikačné profily vírusových i ľudských génov, ktoré sú asociované s procesmi cytotoxicity a viroprotektivity v bunke. |
| Študijný program: | biofyzika |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Využitie moderných metód konfokálnej mikroskopie a respirometrie pri štúdiu metabolickej záťaže srdca |
| Školiteľ: | RNDr. Michal Cagalinec, PhD. |
| Email: | michal.cagalinec@savba.sk |
| Kľúčové slová: | biofotonika, konfokálna mikroskopia, respirometria, srdce, vápniková signalizácia, mitochondria |
| Anotácia: | Kardiovaskulárne komplikácie predstavujú najčastejšiu príčinu morbidity a mortality na svete. Pre detailné štúdium týchto stavov sa čoraz viac uplatňujú moderné biofyzikálne metódy ako biofotonika, konfokálna a superrozlišujúca mikroskopia, či vysokovýkonná respirometria, ktoré sú ideálne pre výskum štruktúry a funkcie buniek, ich organel a špecifických proteínov. Preto tieto metódy využijeme pri štúdiu vápnikovej signalizácie a metabolizmu mitochondrií vo vybraných experimentálnych modeloch metabolickej záťaže srdca. |
Lekárska fakulta Univerzity Komenského v Bratislave
Termín na podávanie prihlášok: do 30. 5. 2025
Viac informácií o prijímacom konaní na stránke fakulty tu.
| Študijný program: | onkológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Konjugované protilátky ADC v liečbe nádorov zo zárodočných buniek rezistentných voči cisplatine |
| Školiteľ: | Mgr. Lucia Kučerová, DrSc. |
| Email: | lucia.kucerova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Chemoresistencia, nádory zo zárodočných buniek, konjugáty protilátky a liečiva, cisplatina, biokonjugáty |
| Anotácia: | Podskupina pacientov s nádorovým ochorením rezistentným voči cisplatine má zlú prognózu a vyžaduje iný efektívny terapeutický prístup. Nádory semenníkov zo zárodočných buniek majú menšiu mieru mutagenity oproti iným nádorovým ochoreniam, čo sa prejavuje aj menším počtom tumor-špecifických antigénov na povrchu nádorových zárodočných buniek, voči ktorým môže byť zacielená špecifická liečba protilátkami. Cieľom tejto práce je identifikovať prítomnosť vhodných antigénov, voči ktorým existujú v klinickej praxi používané liečivá typu konjugát protilátka-liečivo (angl. antibody-drug conjugate, ADC) Pomocou konjugovaných protilátok je cieľom dopraviť cytototoxické liečivo cielene do nádoru a stanoviť cytotoxický a terapeutický efekt u refraktérnych testikulárnych nádorov zo zárodočných buniek. Týmto spôsobom stanovíme možnosť ich využitia v liečbe pacientov s ochorením rezistentným voči cisplatine. |
| Študijný program: | onkológia |
| Forma štúdia: | externá |
| Názov práce: | Liekmi modifikované exozómy z nádorových a mezenchýmových stromálnych buniek ako inovatívny prístup k liečbe nádorov a prevencii procesu metastázovania |
| Školiteľ: | RNDr. Miroslava Matúšková, PhD. |
| Email: | miroslava.matuskova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Nádorové exozómy; pre-metastatická nika; samovražedne nádorové exozómy; prevencia metastázovania |
| Anotácia: | Vzdialené metastázy sú spojené s väčšinou úmrtí súvisiacich s onkologickými ochoreniami. Extracelulárne vezikuly (EV) vylučované nádorovými bunkami a fibroblastmi asociovanými s nádorom, sú zapojené do metastatického procesu a sprostredkúvajú jeho organotropizmus cez zapojenia sa do tvorby premetastatickej niky. Samovražedná génová terapia sprostredkovaná EV konjugovanými s predliečivom, ktoré sú vylučované geneticky modifikovanými mezenchýmovými stromálnymi bunkami, nádorovými bunkami alebo fibroblastmi predstavuje nový a sľubný terapeutický prístup prevencie metastáz prostredníctvom modifikácie premetastatickej niky. Ciele: • Izolovať fibroblasty asociované s nádorom z chirurgicky resekovaných tumorov s cieľom zistiť ich citlivosť na liekmi modifikovane exozómy z mezenchýmových stromálnych buniek • Zistiť či nádorové geneticky modifikované exozómy vedia narušiť tvorbu pre-metastatickej niky zabrániť procesu metastázovania |
| Študijný program: | onkológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Imunitné kontrolné body – charakterizácia a potenciálne využitie v liečbe nádorov |
| Školiteľ: | RNDr. Katarína Lopušná, PhD. |
| Email: | katarina.lopusna@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Imunitné kontrolné body, imunoterapia, nádory |
| Anotácia: | Nádorové bunky exprimujú molekuly imunitných kontrolných bodov, aby sa vyhli rozpoznaniu imunitným systémom. Ich funkciou je viazať sa na T a B bunky a tým potlačiť protinádorové aktivity týchto buniek. Medzi ciele tejto práce patrí: 1. stanoviť expresiu imunitných kontrolných bodov v hematologických nádoroch a zistiť, ktoré signálne dráhy regulujú 2. porovnať expresiu imunitných kontrolných bodov medzi EBV+ a EBV- nádormi 3. identifikovať mutácie imunitných kontrolných bodov v hematologických nádoroch |
| Študijný program: | onkológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Vývoj inovatívneho terapeutického postupu pre liečbu malígneho melanómu uvey |
| Školiteľ: | RNDr. Viera Horváthová Kajabová, PhD. |
| Email: | viera.kajabova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | malígny melanóm uvey, metylácia DNA, remodelácia chromatínu, terapia, epigenetické inhibítory |
| Anotácia: | Malígny melanóm uvey predstavuje najčastejší vnútroočný nádor u dospelých. Naše predchádzajúce výsledky odhalili významnú dysreguláciu expresie génov zapojených v modifikácii histónov a v remodelácii chromatínu u vysoko rizikových pacientov s melanómom uvey v porovnaní s nízko rizikovými. • Primárnym cieľom práce bude zlepšiť pochopenie epigenetických zmien v progresii malígneho melanómu uvey využitím kohorty vzoriek primárneho nádorového tkaniva od pacientov. • Pomocou multiómovej analýzy identifikovať nové terapeutické ciele pre epigenetické inhibítory tretej generácie. • Validovať efektivitu vybranej terapie využitím in vitro/in vivo modelov nádorových xenograftov (PDX – patient-derived xenograft models). |
| Študijný program: | onkológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Prognostické biomarkery nádorových ochorení založené na metódach tekutej biopsie |
| Školiteľ: | Mgr. Matúš Durdík, PhD. |
| Email: | matus.durdik@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Tekutá biopsia, nádory mozgu, rakovina prsníka, génová expresia, sekvenovanie novej generácie, biomarkery, mikroRNA |
| Anotácia: | V súčasnosti sa veľká pozornosť vo výskume nádorových ochorení sústreďuje na objavenie nových biomarkerov, ktoré môžu predpovedať priebeh ochorenia, odpoveď na liečbu a tým prispieť k personalizácii liečby a zníženiu jej nežiadúcich účinkov. Diagnostické techniky využívajúce ako zdroj materiálu telové tekutiny ako krv, sliny, cerebrospinálnu tekutinu a moč sa súhrnne nazývajú tekutá biopsia. Cieľom tejto práce bude vyvinúť markery umožňujúce neinvazívnym spôsobom sledovať progresiu resp. úspešnú liečbu nádorov mozgu a odpoveď na liečbu a výskyt nežiadúcich účinkov u pacientiek s rakovinou prsníka. |
| Študijný program: | onkológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Epigenetické modifikácie ako cieľ pre zvýšenie senzitivity duktálneho adenokarcinómu pankreasu : Terapeutická stratégia založená na nanotechnológii |
| Školiteľ: | Mgr. Verona Buociková, PhD. |
| Email: | verona.buocikova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | duktálny adenokarcinóm pankreasu, epigenetická regulácia, cielená terapia, nanotechnológia |
| Anotácia: | Duktálny adenokarcinóm pankreasu (PDAC) je agresívne nádorové ochorenie so slabým pokrokom v liečbe a nízkou mierou prežívania. V tomto projekte sa preto zameriame na senzibilizáciu buniek PDAC voči štandardne používaným terapiám pomocou cielených nádorovo-špecifických nanočastíc s enkapsulovanými epigenetickými modulátormi. Po definovaní najúčinnejších epigenetických modulátorov a testovaní špecificity zacielenia nanočastíc na bunky PDAC budeme analyzovať účinok funkcionalizovaných nanočastíc na chemosenzibilizáciu nádorov PDAC v pokročilých predklinických modeloch. |
| Študijný program: | onkológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Štúdium črevného mikrobiómu u pacientov s testikulárnymi nádormi z germinatívnych buniek |
| Školiteľ: | doc. RNDr. Soňa Čierniková, PhD. |
| Email: | sona.ciernikova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | mikrobióm, mikrobiálna diverzita, testikulárny karcinóm z germinatívnych buniek, protinádorová liečba |
| Anotácia: | Štúdium mikrobiómu sa v súčasnosti dostáva do popredia onkologického výskumu. U pacientov s rôznymi typmi nádorových ochorení bolo pozorované zmenené zloženie črevnej mikrobioty. Navyše, pribúdajú experimentálne aj klinické štúdie, ktoré poukazujú na dôležitú úlohu mikrobiómu nielen v tumorigenéze, ale tiež v účinnosti protinádorovej terapie. Cieľom dizertačnej práce bude štúdium črevného mikrobiómu u pacientov s testikulárnymi nádormi z germinatívnych buniek. |
| Študijný program: | onkológia |
| Forma štúdia: | externá |
| Názov práce: | Analýza vplyvu zmien črevného mikrobiómu u onkologických pacientov |
| Školiteľ: | doc. RNDr. Soňa Čierniková, PhD. |
| Email: | sona.ciernikova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | črevný mikrobióm, mikrobiálna diverzita, onkologickí pacienti, protinádorová liečba |
| Anotácia: | V súčasnosti sa výskum v oblasti črevného mikrobiómu v onkológii zameriava na dôležitú úlohu mikroorganizmov v etiológii a tiež v progresii rôznych druhov onkologických ochorení. Zmeny v zložení mikrobiómu môžu ovplyvniť imunitnú odpoveď organizmu na nádorové bunky, čo môže podporiť alebo spomaliť vývoj nádorov. Črevný a nádorový mikrobióm zohráva úlohu v odpovedi na protinádorovú terapiu a toxicitu liečby. Cieľom dizertačnej práce bude analýza zmien črevného mikrobiómu u onkologických pacientov a ich vplyvu na klinicko-patologické parametre pacientov. |
| Študijný program: | onkológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Multiomická analýza zmien v nádorovom mikroprostredí u pacientov s pevnými nádormi stratifikovanými na základe prítomnosti karbonickej anhydrázy IX |
| Školiteľ: | RNDr. Monika Baráthová, PhD. |
| Email: | monika.barathova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | nádorové mikroprostredie , hypoxia, karbonická anhydráza IX, terapia, transkriptóm |
| Anotácia: | Nové prístupy v diagnostike a liečbe nádorových ochorení sú dlhé desaťročia v centre vedeckého záujmu. Multiomické analýzy predstavujú v súčasnosti vysokovýkonnú metódu skríningu na efektívne a rýchle odhaľovanie podrobných biologických informácií o nádorovom ochorení. Výsledky takýchto analýz poskytujú informácie o nových biomarkeroch vedúcich k progresii ochorenia a poskytujú zároveň prehľad o zmenách v biologických procesoch medzi zdravým a nádorových tkanivom. Nádorové mikroprostredie (TME) významnou mierou ovplyvňuje nielen progresiu nádorov, ale aj odpoveď na terapiu. Jedným z dôležitých proteínov TME je membránovo asociovaný, hypoxiou-indukovaný enzým karbonická anhydráza IX (CA IX), ktorý prispieva k acidifikácii extracelulárneho mikroprostredia a k adaptácii nádorových buniek na hypoxický stres. Cieľom práce bude analýza transkriptómu nádorov pozitívne testovaných na prítomnosť proteínu CA IX v porovnaní s transkriptómom z korešpondujúceho nenádorového tkaniva. Vybrané molekuly budú overované prostredníctvom funkčných analýz v in vitro modeloch nádorových bunkových kultúr a kokultivačných sféroidov. |
| Študijný program: | normálna a patologická fyziológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Metabolická flexibilita ako marker metabolického zdravia: mechanizmy a molekulárne prediktory |
| Školiteľ: | Mgr. Jozef Ukropec, DrSc. |
| Email: | jozef.ukropec@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Metabolická flexibilita, obezita, lifestyle intervencia, cvičenie, extracelulárne vezikuly, kostrový sval |
| Anotácia: | Metabolická flexibilita je dôležitým determinantom metabolického zdravia, ktorá definuje adaptačnú odpoveď organizmu na cvičenie, či iné zmeny životného štýlu. Cieľom je (i) charakterizovať klinické parametre a molekulárne biomarkery metabolickej flexibility prítomné/uvoľňované do krvi v energeticky náročných situáciách, (cvičenie) a (ii) charakterizovať faktory, ktoré sa uvoľňujú pri cvičení (aj vo forme EV) z hľadiska ich účinkov na proliferáciu, diferenciáciu a metabolickú flexibilitu buniek kostrového svalstva a adipocytov. Vo finálne by sme chceli definovať a validovať biomarker metabolickej flexibility, ktorý dokáže predpovedať reakciu na cvičenie či inú zmenu životného štýlu, a podporiť tak personalizovanú medicínu chronických ochorení spojených s obezitou. |
| Študijný program: | normálna a patologická fyziológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Regulačné T lymfocyty v patogenéze a liečbe sklerózy multiplex |
| Školiteľ: | MUDr. Miroslav Vlček, PhD. |
| Email: | miroslav.vlcek@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Regulačné T lymfocyty, skleróza multiplex, autoimunita |
| Anotácia: | Skleróza multiplex patrí medzi demyelizačné ochorenia centrálneho nervového systému. Patogenéza ochorenia je multifaktoriálna s výraznou úlohou zložiek vrodenej a získanej imunity. Regulačné T lymfocyty hrajú kľúčovú úlohu v regulácií imunitnej reakcie, v tomto prípade ovplyvňovaním počtu a funkcie autoreaktívných T-lymfocytov. V práci sa bude sledovať efekt regulačných T lymfocytov na bunky imunitného systému spolu s možnosťami modifikovania regulačných T lymfocytov za účelom zvýšenia ich supresívneho efektu na ovplyvnenie patogenézy ochorenia. |
Prírodovedecká fakulta Univerzity Komenského v Bratislave
Termín na podávanie prihlášok: do 31. 5. 2025
Viac informácií o prijímacom konaní na stránke fakulty tu.
Viac informácií k prihláške nájdete tu.
| Študijný program: | fyziológia živočíchov |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Molekulárne mechanizmy patogenézy steatotickej choroby pečene spojenej s metabolickou dysfunkciou |
| Školiteľ: | Mgr. Lucia Balážová, PhD. |
| Email: | lucia.balazova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | pečeň, steatóza, fibróza, extracelulárne vezikuly, biomarker |
| Anotácia: | Steatotická choroba pečene spojená s metabolickou dysfunkciou (MASLD) je chronické ochorenie pečene s celosvetovo sa zvyšujúcou prevalenciou. V súčasnosti nie sú dostupné neinvazívne špecifické a citlivé markery tohto ochorenia ani farmakoterapia. Cieľom dizertačnej práce bude skúmať zmeny v cirkulácii u pacientov s MASLD so zameraním na extracelulárne vezikuly ako aj vykonať funkčné štúdie kandidátnych génov zapojených v patogenéze tohto ochorenia pomocou bunkových štúdii a animálneho modelu. Pri realizácii dizertačnej práce budú využívané metódy na manipuláciu génovej expresie, omics analýzy či imunodetekcia. |
| Študijný program: | fyziológia živočíchov |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Identifikácia nových kandidátnych molekúl s potenciálom kontrolovať metabolickú aktivitu tukového tkaniva |
| Školiteľ: | Mgr. Miroslav Baláž, PhD. |
| Email: | miroslav.balaz@savba.sk |
| Kľúčové slová: | tukové tkanivo, adipocyty, metabolizmus, termogenéza, „omics“ analýzy |
| Anotácia: | Metabolická aktivácia tukového tkaniva je považovaná za veľmi sľubnú stratégiu prevencie a liečby obezity a pridružených metabolických ochorení. Cieľom projektu je identifikovať nové molekuly a signálne dráhy s potenciálom riadiť formovanie a aktivitu hnedých a béžových tukových buniek. Experimentálna práca na tukových bunkách, genetických myších modeloch a vzorkách ľudského tukového tkaniva s využitím bežných molekulárno-biologických metód a najnovších prístupov bude prebiehať v Biomedicínskom centre SAV, s možnosťou absolvovať krátkodobý študijný pobyt v zahraničí. |
| Študijný program: | fyziológia živočíchov |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Štúdium úlohy bioaktívnych lipidov v metabolizme tukového tkaniva |
| Školiteľ: | Mgr. Miroslav Baláž, PhD. |
| Email: | miroslav.balaz@savba.sk |
| Kľúčové slová: | tukové tkanivo, adipocyty, metabolizmus, termogenéza, lipidy, mitochondrie |
| Anotácia: | Metabolická aktivácia tukového tkaniva je považovaná za veľmi sľubnú stratégiu prevencie a liečby obezity a metabolických ochorení. Cieľom projektu je skúmať úlohu bioaktívnych lipidov v kontrole metabolizmu tukového tkaniva. Experimentálna práca na tukových bunkách, genetických modeloch myší a vzorkách ľudského hnedého a bieleho tukového tkaniva s využitím bežných molekulárno-biologických techník a najnovších multi-omických prístupov bude prebiehať v Biomedicínskom centre SAV, s možnosťou absolvovať krátkodobý študijný pobyt v zahraničí. |
| Študijný program: | fyziológia živočíchov |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Úloha beta-blokátorov v nádorových bunkách hrubého čreva a prsníka a mechanizmus ich pôsobenia |
| Školiteľ: | prof. Ing. Oľga Križanová, DrSc. |
| Email: | olga.krizanova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | β-adrenergické receptory, vápnikové transportné systémy, sirovodík, nádory hrubého čreva a prsníka |
| Anotácia: | V poslednej dobe preklinické a epidemiologické štúdie naznačujú, že blokátory β-adrenergických receptorov môžu brzdiť progresiu rakoviny a zlepšovať prognózu pri niektorých (nie všetkých) malignitách. Kombinácia β-blokátorov s inými látkami je zaujímavou možnosťou zvýšenia efektivity pri liečbe nádorov. Vychádzame z faktu, že cytotoxický efekt niektorých chemoterapeutík bol v prítomnosti β-blokátorov vyšší. Cieľom dizertačnej práce bude preštudovať úlohu špecifických a nešpecifických β-blokátorov v nádorových bunkách hrubého čreva a prsníka a zistiť poteciálnu úlohu vápnikovej (špecifickým zablokovaním vápnikového transportu) a sulfidovej signalizácie (podaním exogénneho sulfidového donora GYY4137) na pôsobenie β-blokátorov. |
| Študijný program: | fyziológia živočíchov |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Úloha katecholamínov v progresii nádorov hrubého čreva a prsníkov a potenciálna modulácia sirovodíkom |
| Školiteľ: | prof. Ing. Oľga Križanová, DrSc. |
| Email: | olga.krizanova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | adrenalín, noradrenalín, energetický metabolizmus, migrácia, proliferácia, sirovodík, nádory hrubého čreva a prsníka |
| Anotácia: | V súčasných moderných civilizáciach je stres neoddeliteľnou súčasťou života. Katecholamíny patria k prvým signálnym molekulám, ktoré sú za stresu zvýšené. Dlhodobé zvýšenie týchto hladín má za následok rozvoj patofyziologického stavu, ktorý môže indukovať vznik viacerých ochorení, napr. kardiovasku-lárnych, onkologických, atď. Cieľom dizertačnej práce bude preštudovať mechanizmus pôsobenia adrenalínu a noradrenalínu na bunkový metabolizmus u dvoch typov nádorov (nádory hrubého čreva a prsníkové) a zistiť vplyv sirovodíka (ovplyvnením pomocou pomalého sulfidového donora GYY4137) na ich pôsobenie. |
| Študijný program: | fyziológia živočíchov |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Metabolická flexibilita ako marker metabolického zdravia: mechanizmy a molekulárne prediktory |
| Školiteľ: | Mgr. Jozef Ukropec, DrSc. |
| Email: | jozef.ukropec@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Metabolická flexibilita, obezita, lifestyle intervencia, cvičenie, extracelulárne vezikuly, kostrový sval |
| Anotácia: | Metabolická flexibilita je dôležitým determinantom metabolického zdravia, ktorá definuje adaptačnú odpoveď organizmu na cvičenie, či iné zmeny životného štýlu. Cieľom je (i) charakterizovať klinické parametre a molekulárne biomarkery metabolickej flexibility prítomné/uvoľňované do krvi v energeticky náročných situáciách, (cvičenie) a (ii) charakterizovať faktory, ktoré sa uvoľňujú pri cvičení (aj vo forme EV) z hľadiska ich účinkov na proliferáciu, diferenciáciu a metabolickú flexibilitu buniek kostrového svalstva a adipocytov. Vo finálne by sme chceli definovať a validovať biomarker metabolickej flexibility, ktorý dokáže predpovedať reakciu na cvičenie či inú zmenu životného štýlu, a podporiť tak personalizovanú medicínu chronických ochorení spojených s obezitou. |
| Študijný program: | fyziológia živočíchov |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Štúdium účinkov kombinácie fytochemikálií a kovových nanočastíc na gonadálne somatické bunky in vitro |
| Školiteľ: | Mgr. Soňa Scsuková, CSc. |
| Email: | sona.scsukova@hotmail.com |
| Kľúčové slová: | nanočastice, fytochemikálie, gonadálne bunky, steroidogenéza, oxidačný stres, zápal |
| Anotácia: | Rýchly rozvoj nanotechnológií vedie k produkcii inovatívnych (nano)produktov a aplikácií, zároveň však vyvoláva obavy z možného vystavenia ľudí nanočasticiam (NČ) a ich nepriaznivých účinkov na ľudské zdravie. V poslednej dobe sa venuje veľká pozornosť novým prístupom k zvýšeniu biologickej bezpečnosti NČ. Podávanie fytochemikálií s antioxidačnými a protizápalovými vlastnosťami poskytuje sľubný potenciál na zmiernenie nepriaznivých účinkov NČ na biologické systémy. Cieľom dizertačnej práce je objasnenie molekulárnych mechanizmov (apoptóza, oxidačný stres, zápal) účinkov vybraných kovových NČ (striebro, zlato, meď) s rôznymi fyzikálno-chemickými vlastnosťami (veľkosť, povrchová úprava) v kombinácii s fytochemikáliami na funkcie ovariálnych granulóznych buniek a testikulárnych Leydigovych buniek in vitro. |
| Študijný program: | fyziológia živočíchov |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Extracelulárne vezikuly ako mediátory účinkov cvičenia u pacientov s Parkinsonovou chorobou: in vivo a in vitro štúdie |
| Školiteľ: | prof. MUDr. Barbara Ukropcová, PhD. |
| Email: | barbara.ukropcova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Parkinsonova choroba, cvičenie, kostrový sval, mozog, kognitívne funkcie, ľudské svalové bunky, bunkové kultúry neurónov, elektrická pulzná stimulácia, metabolizmus, exerkíny, extracelulárne vezikuly |
| Anotácia: | Pravidelné cvičenie je efektívnym podporným terapeutickým prostriedkom PCh, druhého najčastejšieho neurodegeneratívneho ochorenia. V našej predchádzajúcej práci sme ukázali pozitívny vplyv cvičenia na klinický stav a metabolizmus pacientov s PCh. Cvičenie stimuluje mozgovú plasticitu aj prostredníctvom systémových mechanizmov, ktoré sa aktivujú pri svalovej kontrakcii. Patria k nim exerkíny, bioaktívne molekuly, ktoré sa do cirkulácie uvoľňujú pri cvičení, a pôsobia aj na úrovni mozgu. Exerkíny môžu byť transportované v extracelulárnych vezikulách (EV). Cieľom našich klinických a in vitro štúdií je: 1. stanoviť účinky fyzického cvičenia na mozog (MRI) a kognitívne funkcie (batéria kognitívnych testov) pacientov s mierne a stredne pokročilou PCh; 2. analyzovať vplyv jednorazového a pravidelného cvičenia na exerkíny a EV z krvi, likvoru a z médií svalových buniek pacientov s PCh; 3. skúmať úlohu identifikovaných cvičením regulovaných molekúl v medzibunkovej komunikácii s použitím etablovaných in vitro bunkových modelov. |
| Študijný program: | fyziológia živočíchov |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Cvičenie a mozog: extracelulárne vezikuly a exerkíny v medziorgánovej komunikácii. In vivo a in vitro štúdie |
| Školiteľ: | prof. MUDr. Barbara Ukropcová, PhD. |
| Email: | barbara.ukropcova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | cvičenie, kostrový sval, mozog, kognitívne funkcie, ľudské svalové bunky, adipocyty, bunkové kultúry neurónov, elektrická pulzná stimulácia, metabolizmus, exerkíny, extracelulárne vezikuly |
| Anotácia: | Pravidelné, dostatočne intenzívne fyzické cvičenie je prevenciou so starnutím asociovaného poklesu kognitívnych funkcií, ktoré významne znižuje riziko Alzheimerovej choroby (ACh). Cvičenie stimuluje mozgovú plasticitu aj prostredníctvom systémových mechanizmov, ktoré sa aktivujú pri svalovej kontrakcii. Patria k nim exerkíny, bioaktívne molekuly, ktoré sa do cirkulácie uvoľňujú pri cvičení, a pôsobia aj na úrovni mozgu. Exerkíny môžu byť transportované v extracelulárnych vezikulách (EV). Cieľom našich klinických a in vitro štúdií je: 1. stanoviť účinky fyzického cvičenia na mozog (MRI) a kognitívne funkcie (batéria kognitívnych testov) u seniorov so zvýšeným rizikom vzniku ACh; 2. analyzovať vplyv jednorazového a pravidelného cvičenia na exerkíny a EV z krvi a likvoru mladých aktívnych jedincov a seniorov so zvýšeným rizikom vzniku ACh; 3. skúmať úlohu identifikovaných cvičením regulovaných molekúl v medzibunkovej komunikácii s použitím etablovaných in vitro bunkových modelov. |
| Študijný program: | fyziológia živočíchov |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Vplyv genetických a environmentálnych faktorov na patogenézu autizmu |
| Školiteľ: | doc. RNDr. Ján Bakoš, PhD. |
| Email: | j.bakos@savba.sk |
| Kľúčové slová: | autizmus, neurovývin, sociálne správanie |
| Anotácia: | Príčiny a faktory ovplyvňujúce etiopatogézu porúch autistického spektra sú napriek intenzívnemu výskumu neznáme. Autistická symptomatológia zahŕňajúca deficity v sociálnej interakcii, komunikácii a repetitívne správanie je pravdepodobne kombináciou genetických zmien a nepriaznivých podmienok prostredia. Cieľom práce bude hodnotiť neurovývinové dôsledky v mozgu a na správaní s použitím transgénneho animálneho modelu autizmu a v kombinácii s perinatálnym stresom najmä oddelením matky od potomka. |
| Študijný program: | fyziológia živočíchov |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Zmeny inhibičných neurónov v patogenéze autizmu |
| Školiteľ: | doc. RNDr. Ján Bakoš, PhD. |
| Email: | j.bakos@savba.sk |
| Kľúčové slová: | mozog, GABA, vývin, autizmus |
| Anotácia: | Kyselina gama-aminomaslová (GABA) je jedným z najdôležitejších inhibičných neurotransmiterov v centrálnom nervovom systéme, pričom sa predpokladá, že zmeny GABAergických neurónov sa podieľajú na patogenéze neurovývinových ochorení včítane autizmu. Cieľom práce bude hodnotiť markery a zmeny inhibičnej neurotransmisie v mozgu s použitím transgénneho animálneho modelu autizmu a v súvislosti s analýzou sociálneho správania. |
| Študijný program: | fyziológia živočíchov |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Vápniková signalizácia a metabolizmus mitochondrií pri záťaži srdca |
| Školiteľ: | RNDr. Michal Cagalinec, PhD. |
| Email: | michal.cagalinec@savba.sk |
| Kľúčové slová: | srdce, vápniková signalizácia, mitochondria, fyzická aktivita, ontogenetický vývin |
| Anotácia: | Kardiovaskulárne komplikácie predstavujú najčastejšiu príčinu morbidity a mortality na svete. Tieto zahŕňajú ako zlyhávanie srdca, tak aj komplikácie pri rôznych metabolických ochoreniach, avšak detailné mechanizmy týchto patologických stavov sú na nedostatočne preskúmané na orgánovej, ako aj bunkovej úrovni. Cieľom práce je preto štúdium vápnikovej signalizácie a metabolizmu mitochondrií v experimentálnych modeloch záťaže srdca ako sú napríklad obezita, fyzická aktivita, ontogenetický vývin ako aj zriedkavé dedičné ochorenie Wolframov syndróm. |
| Študijný program: | genetika |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Štúdium biologických funkcií málo charakterizovaných faktorov zostrihu pre-mRNA |
| Školiteľ: | Ing. Ľuboš Čipák, PhD. |
| Email: | lubos.cipak@savba.sk |
| Kľúčové slová: | zostrih pre-mRNA; regulácia expresie génov; afinitná izolácia; S. pombe |
| Anotácia: | Cieľom bude objasniť biologické funkcie málo charakterizovaných faktorov zostrihu pre-mRNA kvasinky Schizosaccharomyces pombe. |
| Študijný program: | genetika |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Identifikácia génov regulujúcich apokrinnú sekréciu |
| Školiteľ: | RNDr. Robert Farkaš, CSc. |
| Email: | robert.farkas@savba.sk |
| Kľúčové slová: | apokrinná sekrécia, intracelulárny transport, mechanizmus externalizácie, genetický skríning, fenotypová analýza, génové interakcie |
| Anotácia: | Apokrinná sekrécia je novo objavený a definovaný od Golgiho aparátu nezávislý nevezikulárny transportný a sekretorický mechanizmus vyskytujúci sa výlučne u metazoálnych eukaryontov, a preto nesie evolučne dôležité signatúrne znaky charakterizujúce túto veľkú systematickú skupinu. Z praktického hľadiska, poruchy apokrinnej sekrécie resp. apokrinných žliaz sú spojené s radom chronických diagnóz a nádorových ochorení. Cieľom nášho výskumu je identifikovať tieto molekulárne determinanty a odhaliť komponenty apokrinnej signálnej dráhy. |
| Študijný program: | genetika |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Transkripčná a epigenetická kontrola metabolizmu mitochondrií nádorových buniek testikulárnych karcinómov |
| Školiteľ: | RNDr. Dana Jurkovičová, DrSc. |
| Email: | dana.jurkovicova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | testikulárne nádory zo zárodočných buniek, lieková rezistencia, mitochondrie, metabolizmus, transkriptóm, aktívny chromatín, glykolýza, oxidatívna fosforylácia, mitofágia, ROS |
| Anotácia: | Cieľ 1: Charakterizovať zmenu expresie génov asociovaných s metabolizmom mitochondrií pri vývoji chemorezistencie testikulárnych karcinómov Cieľ 2: Charakterizovať asociované zmeny epigenetickej kontroly týchto génov pri vývoji chemorezistencie Cieľ 3: Preštudovať potenciálne modulačné intervencie cielené na mitochondrie pre senzibilizáciu rezistentných testikulárnych karcinómov |
| Študijný program: | genetika |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Imunitné kontrolné body – charakterizácia a potenciálne využitie v liečbe nádorov |
| Školiteľ: | RNDr. Katarína Lopušná, PhD. |
| Email: | katarina.lopusna@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Imunitné kontrolné body, imunoterapia, nádory |
| Anotácia: | Nádorové bunky exprimujú molekuly imunitných kontrolných bodov, aby sa vyhli rozpoznaniu imunitným systémom. Ich funkciou je viazať sa na T a B bunky a tým potlačiť protinádorové aktivity týchto buniek. Medzi ciele tejto práce patrí: 1. stanoviť expresiu imunitných kontrolných bodov v hematologických nádoroch a zistiť, ktoré signálne dráhy regulujú 2. porovnať expresiu imunitných kontrolných bodov medzi EBV+ a EBV- nádormi 3. identifikovať mutácie imunitných kontrolných bodov v hematologických nádoroch |
| Študijný program: | genetika |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Vývoj inovatívneho terapeutického postupu pre liečbu malígneho melanómu uvey |
| Školiteľ: | RNDr. Viera Horváthová Kajabová, PhD. |
| Email: | viera.kajabova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | malígny melanóm uvey, metylácia DNA, remodelácia chromatínu, terapia, epigenetické inhibítory |
| Anotácia: | Malígny melanóm uvey predstavuje najčastejší vnútroočný nádor u dospelých. Naše predchádzajúce výsledky odhalili významnú dysreguláciu expresie génov zapojených v modifikácii histónov a v remodelácii chromatínu u vysoko rizikových pacientov s melanómom uvey v porovnaní s nízko rizikovými. • Primárnym cieľom práce bude zlepšiť pochopenie epigenetických zmien v progresii malígneho melanómu uvey využitím kohorty vzoriek primárneho nádorového tkaniva od pacientov. • Pomocou multiómovej analýzy identifikovať nové terapeutické ciele pre epigenetické inhibítory tretej generácie. • Validovať efektivitu vybranej terapie využitím in vitro/in vivo modelov nádorových xenograftov (PDX – patient-derived xenograft models). |
| Študijný program: | genetika |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Štúdium mechanizmov pôsobenia nových chinazolinónových derivátov a ich komplexov s prechodnými kovmi s potenciálom využiteľným v terapii a ochrane ľudského zdravia |
| Školiteľ: | Mgr. Eva Horváthová, PhD. |
| Email: | eva.horvathova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Chinazolinónové deriváty, antioxidačná aktivita, cytotoxicita, genotoxicita, protektivita |
| Anotácia: | Cieľom dizertačnej práce bude: • štúdium pôsobenia nových chinazolinónových derivátov na rôznych ľudských bunkových líniách izolovaných z nádorov prsníka a/alebo testes (resp. ich nenádorových ekvivalentov) kultivovaných in vitro • s použitím rôznych postupov určiť ich antioxidačný potenciál, prežívanie, vplyv na hladinu poškodenia DNA, bunkový metabolizmus a cyklus • štúdium účinkov derivátov v kombinácii s rôznymi modelovými mutagénmi/karcinogénmi |
| Študijný program: | genetika |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Biologická analýza nových faktorov zapojených do zostrihu pre-mRNA |
| Školiteľ: | RNDr. Miroslava Kretová, PhD. |
| Email: | miroslava.kretova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | zostrih pre-mRNA, zostrihové faktory, komplex zostrihu, afinitná purifikácia, Schizosaccharomyces pombe |
| Anotácia: | Cieľom dizertačnej práce je podrobné preskúmanie nových faktorov deliacej kvasinky S. pombe na molekulárnej úrovni, o ktorých predpokladáme, že sú zapojené do zostrihu pre-mRNA. |
| Študijný program: | genetika |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Identifikácia genetických príčin v prípadoch s nediagnostikovaným zriedkavým ochorením s využitím pokročilých NGS prístupov |
| Školiteľ: | RNDr. Martina Škopková, PhD. |
| Email: | martina.skopkova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Zriedkavé ochorenia, diagnostika, celogenómové sekvenovanie, metylóm, transkriptóm |
| Anotácia: | Cieľom práce bude odhaliť genetické príčiny v prípadoch pacientov so zriedkavým ochorením, kde sa nepodarilo stanoviť diagnózu celoexómovým sekvenovaním. Bude preto zahŕňať hľadanie príčiny na úrovni celého genómu vrátane analýzy CNV a štrukturálnych prestavieb, zmien v metylačných profiloch, či v transkriptóme. V závislosti od nálezov sa budú odvíjať prípadné funkčné štúdie. Práca bude vyžadovať multidisciplinárny prístup a komunikáciu s bioinformatikom i lekárom. |
| Študijný program: | genetika |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Epigenetické modifikácie ako cieľ pre zvýšenie senzitivity duktálneho adenokarcinómu pankreasu : Terapeutická stratégia založená na nanotechnológii |
| Školiteľ: | Mgr. Verona Buociková, PhD. |
| Email: | verona.buocikova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | duktálny adenokarcinóm pankreasu, epigenetická regulácia, cielená terapia, nanotechnológia |
| Anotácia: | Duktálny adenokarcinóm pankreasu (PDAC) je agresívne nádorové ochorenie so slabým pokrokom v liečbe a nízkou mierou prežívania. V tomto projekte sa preto zameriame na senzibilizáciu buniek PDAC voči štandardne používaným terapiám pomocou cielených nádorovo-špecifických nanočastíc s enkapsulovanými epigenetickými modulátormi. Po definovaní najúčinnejších epigenetických modulátorov a testovaní špecificity zacielenia nanočastíc na bunky PDAC budeme analyzovať účinok funkcionalizovaných nanočastíc na chemosenzibilizáciu nádorov PDAC v pokročilých predklinických modeloch. |
| Študijný program: | molekulárna biológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Nové prístupy v získavaní epidemiologických dát komármi prenášaných vírusov |
| Školiteľ: | RNDr. Viktória Čabanová, PhD. |
| Email: | viktoria.cabanova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | komáre, vírusy, NGS, Oxford Nanopore, nové metódy odberu vzoriek |
| Anotácia: | Nové metódy odberu vzoriek pri výskume a sledovaní komármi prenášaných vírusov zefektívňujú spracovanie vzoriek ako aj získavanie epidemiologických dát. Častokrát však predstavujú výzvu pre ďalšie analýzy, ako je aj NGS. Zosúladenie pohodlného odberu vzoriek a kvality sekvenovania pritom môže zefektívniť prácu nie len vedcov, ale aj epidemiológov. Cieľom dizertačnej práce je vytvorenie metodiky spracovania vzoriek a prípravy NGS knižnice pre materiál odobratý novými prístupmi, ako sú napríklad karty uchovávajúce nukleové kyseliny, suché kvapky telesných tekutín, sliny a exkréty komárov. |
| Študijný program: | molekulárna biológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Biologická analýza nových faktorov zapojených do zostrihu pre-mRNA |
| Školiteľ: | RNDr. Miroslava Kretová, PhD. |
| Email: | miroslava.kretova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | zostrih pre-mRNA, zostrihové faktory, komplex zostrihu, afinitná purifikácia, Schizosaccharomyces pombe |
| Anotácia: | Cieľom dizertačnej práce je podrobné preskúmanie nových faktorov deliacej kvasinky S. pombe na molekulárnej úrovni, o ktorých predpokladáme, že sú zapojené do zostrihu pre-mRNA. |
| Študijný program: | molekulárna biológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Identifikácia genetických príčin v prípadoch s nediagnostikovaným zriedkavým ochorením s využitím pokročilých NGS prístupov |
| Školiteľ: | RNDr. Martina Škopková, PhD. |
| Email: | martina.skopkova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Zriedkavé ochorenia, diagnostika, celogenómové sekvenovanie, metylóm, transkriptóm |
| Anotácia: | Cieľom práce bude odhaliť genetické príčiny v prípadoch pacientov so zriedkavým ochorením, kde sa nepodarilo stanoviť diagnózu celoexómovým sekvenovaním. Bude preto zahŕňať hľadanie príčiny na úrovni celého genómu vrátane analýzy CNV a štrukturálnych prestavieb, zmien v metylačných profiloch, či v transkriptóme. V závislosti od nálezov sa budú odvíjať prípadné funkčné štúdie. Práca bude vyžadovať multidisciplinárny prístup a komunikáciu s bioinformatikom i lekárom. |
| Študijný program: | molekulárna biológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Štúdium vzájomných interakcií medzi vírusom kliešťovej encefalitídy a hostiteľom v koži ex vivo |
| Školiteľ: | Mgr. Pavlína Bartíková, PhD. |
| Email: | pavlina.bartikova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Vírus kliešťovej encefalitídy, koža, vrodená imunitná odpoveď, cytokíny |
| Anotácia: | Je všeobecne známe, že vírus kliešťovej encefalitídy je neuro-tropný a najčastejším spôsobom infekcie sú cicajúce infekčné kliešte. Výsledok infekcie je teda ovplyvnený interakciami medzi kliešťami, vírusom a hostiteľom v koži. Informácií o nich je však veľmi málo. Použitie ex vivo modelu ľudskej kože môže pomôcť pochopiť a objasniť niektoré z molekulárnych mechanizmov infekcie v koži a doplniť niektoré chýbajúce časti skladačky k poznaniu zložitosti vírus – hostiteľ. Ciele práce: zaviesť kultiváciu explantátov ľudskej kože; nastaviť vhodnú infekciu; pozorovanie, skúmanie a porovnávacia analýza vzájomných interakcií – replikácia a šírenie vírusu verzus vrodená imunitná odpoveď v kožných explantátoch po infekcii |
| Študijný program: | molekulárna biológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Epigenetické mechanizmy v procese tvorby metastáz |
| Školiteľ: | doc. Mgr. Andrea Šoltýsová, PhD. |
| Email: | andrea.soltysova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Epigenetika, metastázy, metylácia, liečba |
| Anotácia: | Najnovšie poznatky ukazujú, že epigenetika hrá dôležitú úlohu vo vývoji nádorového ochorenia ako aj v jeho progresii a pri tvorbe metastáz. V rámci práce budú identifikované a následne študované kandidátne gény, ktoré by mohli zohrávať kľúčovú úlohu vo vzniku alebo šírení metastáz. Pochopenie mechanizmov v metastatických bunkách by mohlo viesť k výberu vhodnej terapii. |
| Študijný program: | molekulárna biológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Štúdium implementácie moderných genetických analýz v klinických diagnostických postupoch u pacientov bez jasnej a jednoznačnej klinickej diagnózy |
| Školiteľ: | doc. RNDr. Ján Radvánszky, PhD. |
| Email: | jan.radvanszky@savba.sk |
| Kľúčové slová: | zriedkavé ochorenia, WGS, WES, personalizovaná medicína |
| Anotácia: | Projekt je zameraný na možnosti dodiagnostikovania pacientov so zriedkavými až individuálnymi geneticky podmienenými ochoreniami, u ktorých doterajšie klinicky dostupné postupy neviedli k stanoveniu diagnózy. Hlavným vedeckým cieľom projektu je analyzovať a charakterizovať potenciál prechodu od analýz exómu (WES), ktoré už sú súčasťou diagnostickej praxe, na analýzu celého genómu (WGS), ktorá pokrýva aj nekódujúce časti genómu a dáva možnosť detailnejšie hodnotiť takmer všetky druhy genetickej variability. Pomocou WGS zanalyzujeme DNA pacientov s cieľom odhaliť genetickú príčinu/y ich ochorenia. Očakávame odhalenie nových variantov v už známych génoch, ako aj v nových kandidátnych génoch zapojených do patofyziológie zriedkavých ochorení. Tieto nové zistenia možno rozvíjať v rámci budúcich projektov základného výskumu. Náš prístup tzv. personalizovanej medicíny tiež môže prispieť k voľbe adekvátnej terapie pre pacientov. |
| Študijný program: | molekulárna biológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Multiomická analýza zmien v nádorovom mikroprostredí u pacientov s pevnými nádormi stratifikovanými na základe prítomnosti karbonickej anhydrázy IX |
| Školiteľ: | RNDr. Monika Baráthová, PhD. |
| Email: | monika.barathova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | nádorové mikroprostredie , hypoxia, karbonická anhydráza IX, terapia, transkriptóm |
| Anotácia: | Nové prístupy v diagnostike a liečbe nádorových ochorení sú dlhé desaťročia v centre vedeckého záujmu. Multiomické analýzy predstavujú v súčasnosti vysokovýkonnú metódu skríningu na efektívne a rýchle odhaľovanie podrobných biologických informácií o nádorovom ochorení. Výsledky takýchto analýz poskytujú informácie o nových biomarkeroch vedúcich k progresii ochorenia a poskytujú zároveň prehľad o zmenách v biologických procesoch medzi zdravým a nádorových tkanivom. Nádorové mikroprostredie (TME) významnou mierou ovplyvňuje nielen progresiu nádorov, ale aj odpoveď na terapiu. Jedným z dôležitých proteínov TME je membránovo asociovaný, hypoxiou-indukovaný enzým karbonická anhydráza IX (CA IX), ktorý prispieva k acidifikácii extracelulárneho mikroprostredia a k adaptácii nádorových buniek na hypoxický stres. Cieľom práce bude analýza transkriptómu nádorov pozitívne testovaných na prítomnosť proteínu CA IX v porovnaní s transkriptómom z korešpondujúceho nenádorového tkaniva. Vybrané molekuly budú overované prostredníctvom funkčných analýz v in vitro modeloch nádorových bunkových kultúr a kokultivačných sféroidov. |
| Študijný program: | mikrobiológia a virológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Aplikácia multiomických prístupov v štúdiu diseminácie rickettsií v kliešťoch ako kompetentných vektoroch |
| Školiteľ: | RNDr. Lenka Minichová, PhD. |
| Email: | lenka.minichova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Rickettsie, kliešte, multiomické prístupy |
| Anotácia: | Štúdium vektorov, najmä kliešťov, nadobúda na význame v súvislosti s klimatickými zmenami a ich expanziou do nových geografických oblastí, pričom si so sebou prinášajú patogény, ktoré sa v minulosti na našom území nevyskytovali. Doteraz boli štúdie rickettsií prevažne realizované in vitro (na bunkových kultúrach), no v tejto práci použijeme in vivo model (experimentálne infekcie kliešťov, ktoré sú ich kompetentnými vektormi). Cieľom dizertačnej práce bude infikovať kliešte rickettsiami a následne vyvinúť a aplikovať moderné prístupy na vizualizáciu, identifikáciu a charakterizáciu zmien v kliešťoch spôsobených prítomnosťou rickettsií, s využitím pokročilých omických metód. Výskum prispieva k lepšiemu pochopeniu interakcií medzi kliešťami a rickettsiami, čo povedie k novým prístupom v prevencii a diagnostike ochorení prenášaných kliešťami. |
| Študijný program: | mikrobiológia a virológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Pôvodcovia rickettsióz a iných kliešťami prenášaných ochorení: perspektívy neantibiotickej terapie |
| Školiteľ: | Mgr. Eva Špitalská, PhD. |
| Email: | eva.spitalska@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Kliešťami prenášaný patogén, kliešť, človek, variabilita, ochorenie, nanomateriál |
| Anotácia: | Rickettsiózy patria medzi najstaršie známe ochorenia prenášané vektormi. Lymská borelióza je najčastejšou infekciou prenášanou kliešťami. Geografická distribúcia rickettsií súvisí s ich vektormi. Stále sa identifikujú nové prípady rickettsióz a nové lokality, kde je prítomnosť týchto baktérií rozpoznaná. Antibiotická rezistencia je celosvetový problém a možno jedného dňa liečba chorôb prenášaných kliešťami nebude účinná. Cieľom štúdie je poznať pôvodcov kliešťami prenášaných ochorení, ich variabilitu, diagnostika týchto ochorení a ich liečba vo včasnom štádiu akútnej infekcie použitím nových nanomateriálov. |
| Študijný program: | mikrobiológia a virológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | In vitro a in vivo charakterizácia nanosystémov proti vírusu kliešťovej encefalitídy |
| Školiteľ: | RNDr. Juraj Koči, PhD. |
| Email: | juraj.koci@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Vírus kliešťovej encefalitídy, kliešťová encefalitída, vírus-blokujúce nanoprotilátky, vírus-blokujúce peptidy, nanosystémy, hematoencefalická bariéra, vírus-neutralizačná aktivita |
| Anotácia: | Kliešťová encefalitída je klinicky významné arbovírusové ochorenie s potenciálne agresívnymi neurologickými následkami. Až v 30 % symptomatických prípadov môže infekcia spôsobená vírusom kliešťovej encefalitídy (TBEV) prejsť do chronickej a perzistujúcej encefalitídy, pre ktorú nie je dostupná žiadna špecifická liečba. Nanoprotilátky ťavy (Nb) a malé blokujúce peptidy (bP) zamerané na doménu III (DIII) vírusu, potrebnú na prichytenie a vstup do bunky, ponúkajú elegantné nástroje na blokovanie vírusu. Konjugáciou DIII-špecifických Nb a bP s biokompatibilnými nanonosičmi a peptidom umožňujúcim prechod vysokoselektívnou hematoencefalickou bariérou je možné vytvoriť nanosystémy s vírus-neutralizačnou aktivitou. Cieľom tejto dizertačnej práce bude otestovať bezpečnosť, biodistribúciu a TBEV-neutralizačný potenciál nanosystémov in vitro a in vivo pomocou reportérového TBEV. |
| Študijný program: | mikrobiológia a virológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Úloha bunkových lipidov v životnom cykle vírusov: Mechanizmy interakcií a zmeny v metabolizme lipidov počas vírusovej infekcie |
| Školiteľ: | Ing. Jana Tomášková, PhD. |
| Email: | jana.tomaskova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | metabolizmus, lipidy, RNA vírus, interakcia vírus-hostiteľ |
| Anotácia: | Cieľom dizertačnej práce je skúmať zmeny v metabolizme bunkových lipidov vyvolané infekciou vírusom lymfocytovej choriomeningitídy (LCMV) a potenciálne inými vírusmi z radu Bunyavirales. Výskum sa zameria na identifikáciu špecifických zmien v lipidovom zložení a ich regulácii v hostiteľských bunkách počas infekcie. Ďalším cieľom bude objasniť úlohu týchto lipidov v životnom cykle skúmaných vírusov, vrátane ich vplyvu na vírusovú replikáciu, zostavovanie viriónov a interakcie s hostiteľskými bunkovými štruktúrami. Práca bude kombinovať pokročilé analytické metódy, ako je lipidomická analýza a molekulárne biologické techniky, na identifikáciu kľúčových lipidových tried a ich zmien počas infekcie. Zároveň bude skúmať, či zasiahnutie lipidového metabolizmu môže predstavovať terapeutický cieľ na potlačenie vírusovej replikácie. |
| Študijný program: | mikrobiológia a virológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Imunitné kontrolné body – charakterizácia a potenciálne využitie v liečbe nádorov |
| Školiteľ: | RNDr. Katarína Lopušná, PhD. |
| Email: | katarina.lopusna@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Imunitné kontrolné body, imunoterapia, nádory |
| Anotácia: | Nádorové bunky exprimujú molekuly imunitných kontrolných bodov, aby sa vyhli rozpoznaniu imunitným systémom. Ich funkciou je viazať sa na T a B bunky a tým potlačiť protinádorové aktivity týchto buniek. Medzi ciele tejto práce patrí: 1. stanoviť expresiu imunitných kontrolných bodov v hematologických nádoroch a zistiť, ktoré signálne dráhy regulujú 2. porovnať expresiu imunitných kontrolných bodov medzi EBV+ a EBV- nádormi 3. identifikovať mutácie imunitných kontrolných bodov v hematologických nádoroch |
| Študijný program: | mikrobiológia a virológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Pokroky v sekvenovaní vírusov prenášaných komármi – pohodlný odber vzoriek versus dostatok dát |
| Školiteľ: | RNDr. Viktória Čabanová, PhD. |
| Email: | viktoria.cabanova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | komáre, vírusy, NGS, Oxford Nanopore, nové metódy odberu vzoriek |
| Anotácia: | Nové metódy odberu vzoriek pri výskume a sledovaní komármi prenášaných vírusov zefektívňujú spracovanie vzoriek ako aj získavanie epidemiologických dát. Častokrát však predstavujú výzvu pre ďalšie analýzy, ako je aj NGS. Zosúladenie pohodlného odberu vzoriek a kvality sekvenovania pritom môže zefektívniť prácu nie len vedcov, ale aj epidemiológov. Cieľom dizertačnej práce je vytvorenie metodiky spracovania vzoriek a prípravy NGS knižnice pre materiál odobratý novými prístupmi, ako sú napríklad karty uchovávajúce nukleové kyseliny, suché kvapky telesných tekutín, sliny a exkréty komárov. |
| Študijný program: | mikrobiológia a virológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Štúdium faktorov virulencie Rickettsia spp. pomocou vybraných Omik metód |
| Školiteľ: | Mgr. Marco Quevedo Diaz, PhD |
| Email: | marco.quevedo-diaz@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Rickettsia, virulenčne faktory, Rickettsiózy, lipopolysacharid, efektorové proteíny |
| Anotácia: | Obligátne intracelulárne bakteriálne patogény sú organizmy, ktoré nevyhnutne vyžadujú eukaryotického hostiteľa na prežitie a replikáciu, a preto vyvinuli faktory virulencie, aby zabránili rôznym formám smrti hostiteľských buniek a zachovali si svoju replikačnú niku. Príklady faktorov virulencie sú toxíny, ktoré inhibujú fagocytózu a povrchové receptory (lipopolysacharidy, lipoproteíny), ktoré sa viažu na hostiteľské bunky. Z týchto makromolekúl majú lipopolysacharidy osobitný mikrobiologický, imunologický a medicínsky význam. Rickettsie využívajú rôzne skupiny povrchovo exponovaných alebo vylučovaných proteínov na zabezpečovanie svojich intracelulárnych životných cyklov v cieľových bunkách a tiež na dosahovanie úspešnej infekcie. Hlavným cieľom tejto práce je identifikácia a charakterizácia makromolekúl a faktorov rickettsiovej virulencie pomocou vybraných omík. |
| Študijný program: | mikrobiológia a virológia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Štúdium vzájomných interakcií medzi vírusom kliešťovej encefalitídy a hostiteľom v koži ex vivo |
| Školiteľ: | Mgr. Pavlína Bartíková, PhD. |
| Email: | pavlina.bartikova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Vírus kliešťovej encefalitídy, koža, vrodená imunitná odpoveď, cytokíny |
| Anotácia: | Je všeobecne známe, že vírus kliešťovej encefalitídy je neuro-tropný a najčastejším spôsobom infekcie sú cicajúce infekčné kliešte. Výsledok infekcie je teda ovplyvnený interakciami medzi kliešťami, vírusom a hostiteľom v koži. Informácií o nich je však veľmi málo. Použitie ex vivo modelu ľudskej kože môže pomôcť pochopiť a objasniť niektoré z molekulárnych mechanizmov infekcie v koži a doplniť niektoré chýbajúce časti skladačky k poznaniu zložitosti vírus – hostiteľ. Ciele práce: zaviesť kultiváciu explantátov ľudskej kože; nastaviť vhodnú infekciu; pozorovanie, skúmanie a porovnávacia analýza vzájomných interakcií – replikácia a šírenie vírusu verzus vrodená imunitná odpoveď v kožných explantátoch po infekcii |
| Študijný program: | biochémia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Biologické a väzobné vlastnosti vybraných vírusových a ľudských glykoproteínov a ich klinicky význam pri imunitnej odpovedi |
| Školiteľ: | Mgr. Ivana Nemčovičová, PhD. |
| Email: | ivana.nemcovicova@savba.sk |
| Kľúčové slová: | vírus, glykoproteín, bunkový receptor, proteínové interakcie, immunomodulácia, rekombinantný expresný systém, genetická manipulácia, kryštalizácia, štruktúrna analýza |
| Anotácia: | Hlavným cieľom práce je podrobne skúmať molekulárne základy imunitného rozpoznávania klinicky významných glykoproteínov kódovaných ľudskými vírusmi. Za týmto účelom plánujeme rekombinantne pripraviť, charakterizovať a stanoviť expresné a purifikačné profily vírusových i ľudských génov, ktoré sú asociované s procesmi cytotoxicity a viroprotektivity v bunke. |
| Študijný program: | biochémia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Imunitné kontrolné body – charakterizácia a potenciálne využitie v liečbe nádorov |
| Školiteľ: | RNDr. Katarína Lopušná, PhD. |
| Email: | katarina.lopusna@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Imunitné kontrolné body, imunoterapia, nádory |
| Anotácia: | Nádorové bunky exprimujú molekuly imunitných kontrolných bodov, aby sa vyhli rozpoznaniu imunitným systémom. Ich funkciou je viazať sa na T a B bunky a tým potlačiť protinádorové aktivity týchto buniek. Medzi ciele tejto práce patrí: 1. stanoviť expresiu imunitných kontrolných bodov v hematologických nádoroch a zistiť, ktoré signálne dráhy regulujú 2. porovnať expresiu imunitných kontrolných bodov medzi EBV+ a EBV- nádormi 3. identifikovať mutácie imunitných kontrolných bodov v hematologických nádoroch |
| Študijný program: | biochémia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Metabolická flexibilita ako marker metabolického zdravia: mechanizmy a molekulárne prediktory |
| Školiteľ: | Mgr. Jozef Ukropec, DrSc. |
| Email: | jozef.ukropec@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Metabolická flexibilita, obezita, lifestyle intervencia, cvičenie, extracelulárne vezikuly, kostrový sval |
| Anotácia: | Metabolická flexibilita je dôležitým determinantom metabolického zdravia, ktorá definuje adaptačnú odpoveď organizmu na cvičenie, či iné zmeny životného štýlu. Cieľom je (i) charakterizovať klinické parametre a molekulárne biomarkery metabolickej flexibility prítomné/uvoľňované do krvi v energeticky náročných situáciách, (cvičenie) a (ii) charakterizovať faktory, ktoré sa uvoľňujú pri cvičení (aj vo forme EV) z hľadiska ich účinkov na proliferáciu, diferenciáciu a metabolickú flexibilitu buniek kostrového svalstva a adipocytov. Vo finálne by sme chceli definovať a validovať biomarker metabolickej flexibility, ktorý dokáže predpovedať reakciu na cvičenie či inú zmenu životného štýlu, a podporiť tak personalizovanú medicínu chronických ochorení spojených s obezitou. |
Fakulta chemickej a potravinárskej technológie Slovenskej technickej univerzity v Bratislave
Termín na podávanie prihlášok: do 31. 5. 2025
Viac informácií o prijímacom konaní na stránke fakulty tu.
| Študijný program: | biochémia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Úloha proteínkináz v regulácií procesov zostrihu pre-mRNA |
| Školiteľ: | Ing. Ľuboš Čipák, PhD. |
| Email: | lubos.cipak@savba.sk |
| Kľúčové slová: | proteínkináza; zostrih pre-mRNA; regulácia expresie génov; afinitná purifikácia; S. pombe |
| Anotácia: | Cieľom bude objasniť biologické funkcie vybraných proteínkináz v regulácii zostrihu pre-mRNA kvasinky Schizosaccharomyces pombe. |
| Študijný program: | biochémia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Imunitné kontrolné body – charakterizácia a potenciálne využitie v liečbe nádorov |
| Školiteľ: | RNDr. Katarína Lopušná, PhD. |
| Email: | katarina.lopusna@savba.sk |
| Kľúčové slová: | Imunitné kontrolné body, imunoterapia, nádory |
| Anotácia: | Nádorové bunky exprimujú molekuly imunitných kontrolných bodov, aby sa vyhli rozpoznaniu imunitným systémom. Ich funkciou je viazať sa na T a B bunky a tým potlačiť protinádorové aktivity týchto buniek. Medzi ciele tejto práce patrí: 1. stanoviť expresiu imunitných kontrolných bodov v hematologických nádoroch a zistiť, ktoré signálne dráhy regulujú 2. porovnať expresiu imunitných kontrolných bodov medzi EBV+ a EBV- nádormi 3. identifikovať mutácie imunitných kontrolných bodov v hematologických nádoroch |
| Študijný program: | biochémia |
| Forma štúdia: | denná |
| Názov práce: | Štúdium účinkov kombinácie fytochemikálií a kovových nanočastíc na gonadálne somatické bunky in vitro |
| Školiteľ: | Mgr. Soňa Scsuková, CSc. |
| Email: | sona.scsukova@hotmail.com |
| Kľúčové slová: | nanočastice, fytochemikálie, gonadálne bunky, steroidogenéza, oxidačný stres, zápal |
| Anotácia: | Rýchly rozvoj nanotechnológií vedie k produkcii inovatívnych (nano)produktov a aplikácií, zároveň však vyvoláva obavy z možného vystavenia ľudí nanočasticiam (NČ) a ich nepriaznivých účinkov na ľudské zdravie. V poslednej dobe sa venuje veľká pozornosť novým prístupom k zvýšeniu biologickej bezpečnosti NČ. Podávanie fytochemikálií s antioxidačnými a protizápalovými vlastnosťami poskytuje sľubný potenciál na zmiernenie nepriaznivých účinkov NČ na biologické systémy. Cieľom dizertačnej práce je objasnenie molekulárnych mechanizmov (apoptóza, oxidačný stres, zápal) účinkov vybraných kovových NČ (striebro, zlato, meď) s rôznymi fyzikálno-chemickými vlastnosťami (veľkosť, povrchová úprava) v kombinácii s fytochemikáliami na funkcie ovariálnych granulóznych buniek a testikulárnych Leydigovych buniek in vitro. |
